צמחייה מוסיפה יופי לאקווריום, מדמה את סביבת החיים של הדגים בטבע, ומספקת מקומות מסתור ורבייה לדגים. צמחייה טבעית מצריכה טיפול והשקעה – יש להניח מצע מתאים לשתילת הצמחים והשרשתם, להוסיף חומרי דישון, ולגזום אזורים שנרקבים או צומחים יתר על המידה. כאשר בוחרים באקווריום מסוג זה, יש להימנע מגידול דגים הניזונים מהצמחייה. ניתן להוסיף מערכות להוספת CO2 המאיצות תהליכי פוטוסינתזה.