האקווריומים מתחלקים לסוגים, לפי סוג המים שהם מכילים – מתוקים או מלוחים, וטמפרטורת המים הרצויה (חמים או קרים). טמפרטורת המים במיכל נקבעת על ידי גוף חימום ותרמוסטט, וזאת כדי לתת לדגים שמקורם באזורי אקלים טרופיים סביבת חיים מתאימה.